Химия - Бактериородопсин
01 марта 2011Тример бактериородопсина | |
Обозначения в базах данных | |
---|---|
Pfam | PF01036 |
InterPro | IPR001425 |
PROSITE | PDOC00291 |
SCOP | 2brd |
TCDB | 3.E.1 |
OPM family | 6 |
OPM protein | 1vgo |
семейство мембранных светочувствительных белков археот. Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану, по строению сходны с родопсинами млекопитающих.
Состав белка
Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных α-спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая β-шпилька и все нерегулярные участки цепи выходят из мембраны. Сидящие на α-спиралях гидрофобные группы обращенны «наружу» к липидам мембраны. Полярные же группы обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.
Процесс переноса протона через мембрану
Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из полностью-транс в 13-цис форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.
Просмотров: 1613
|