Химия - Бактериородопсин

01 марта 2011

Тример бактериородопсина
Обозначения в базах данных
Pfam	PF01036
InterPro	IPR001425
PROSITE	PDOC00291
SCOP	2brd
TCDB	3.E.1
OPM family	6
OPM protein	1vgo

семейство мембранных светочувствительных белков археот. Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану, по строению сходны с родопсинами млекопитающих.

Состав белка

Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных α-спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая β-шпилька и все нерегулярные участки цепи выходят из мембраны. Сидящие на α-спиралях гидрофобные группы обращенны «наружу» к липидам мембраны. Полярные же группы обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.

Процесс переноса протона через мембрану

Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора — ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из полностью-транс в 13-цис форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.

Просмотров: 1613

<<<