Химия - Деацетилазы гистонов (HDAC) - Классификация

21 июля 2011


Оглавление:
1. Деацетилазы гистонов (HDAC)
2. Классификация
3. Сиртуины



Семейство состоит из 18 белков, пренадлежщих к 4 классам. 11 представителей, принадлежащие к I-подобные; HDAC1, HDAC2, HDAC3, HDAC8) , II и IV классам, названы «классическими» гистон деацетилазами, в то время как представители класса III названы сиртуинами. Представители I и II классов ингибируются трихостатином А, в то время как представители других классов нечувствительны к нему.

У растений семейство гистондеацетилаз тоже включает 18 представителей, принадлежащих к 3 классам: I, HD-туины и сиртуины.

Механизм катализа

Последовательность из 390 остатков аминокислот образует каталитический домен классических HDAC, который включает также высококонсервативные аминокислоты. Активный сайт представляет собой слегка искривленный трубчатый карман с более широким дном. Ацетильная группа удаляется путем системы с переменой заряда, состоящей из двух соседних гистидинов, двух аспартатов, а также тирозина. Важный компонент системы перемены зарядов — Zn, связанный на дне кармана. Для катализа также важны другие кофакторы: большинство рекомбинантных гистондеацетилаз неактивно.



Просмотров: 3168


<<< Глутатионпероксидазы
Дигидрофолат редуктаза >>>