Химия - Хитиназы - Классификация углеводсвязывающих участков

28 февраля 2011


Оглавление:
1. Хитиназы
2. Классификация углеводсвязывающих участков
3. Расщепление хитина хитиназами in vivo в бактериях
4. Физиологическая роль хитиназ
5. Хитинолитические ферменты как фактор антагонизма бактериальных штаммов
6. Значение хитиназ и перспективы их использования

Важную роль в классификации хитиназ и хитинолитических комплексов играют так называемые хитинсвязывающие домены, принадлежащие к различным семействам углеводсвязывающих участков CBM. Среди семейств, содержащих в своем составе хитинсвязывающие домены, можно выделить 4 основных: CBM12, CBM14, CBM18, CBM19.

CBM выполняют роль связывания с различными полисахаридными субстратами, зачастую нерастворимыми в воде. CBM-кодирующие последовательности могут находиться как в составе гена хитиназы, так и иметь собственную ORF, продуктом которой является соответствующий углеводсвязывающий белок.

Таблица 2. Характеристика семейств CBM, выполняющих хитинсвязывающую функцию.

Семейство CBM	Количество аминокислотных остатков	Структура	Распространение	Примечания
CBM1	~40	Цистеиновый узел	Принадлежащая III классу хитиназа Cht1 микромицета Hypocrea virens
CBM2	~100	β-сэндвич	В составе бактериальных ферментов
CBM5	~60	Уникальная	В составе бактериальных ферментов
CBM12	40-60	Уникальная	В составе бактериальных ферментов.	Большинство модулей семейства принадлежит к хитинсвязывающим
CBM14	~70	Уникальная, содержит гевеин-подобную последовательность	Гидроидные полипы, нематоды, ракообразные, паукообразные, насекомые, головохордовые, костные рыбы, мышь, человек	В составе семейства многочисленны хитинсвязывающие домены. Найдены модули, как присоединенные к каталитическому хитиназному домену, так и те, которые находятся в составе белков без каталитической функции, в изолированном состоянии либо в составе многократных повторов
CBM18	~40	Гевеиновая последовательность	Растения, грибы	Большинство модулей семейства принадлежит к хитинсвязывающим. Найдены модули, как присоединенные к каталитическому хитиназному домену, так и те, которые находятся в составе белков без каталитической функции, в изолированном состоянии либо в составе многократных повторов
CBM19	60-70	—	Грибы	Для модулей семейства характерна только хитинсвязывающая функция
CBM33	—	—	Хитинсвязывающий белок бактерии Serratia marcescens
CBM37	~100	—	Ферменты бактерии Ruminococcus albus	Хитинсвязывающая функция не является основной

Просмотров: 6017

<<< Семейство GH97