Химия - Лизоцим - Механизм лизиса

01 марта 2011


Оглавление:
1. Лизоцим
2. История
3. Механизм лизиса

Фермент атакует пептидогликаны, входящие в состав клеточных стенок бактерий. Лизоцим гидролизует-гликозидную связь между N-ацетилмурамовой кислотой и N-ацетилглюкозамином. Пептидогликан при этом связывается с активным центром фермента, расположенным между двумя его структурными доменами. Сорбционный центр лизоцима представляет 6 карманов, причем в A, C и E может связыватся только N-ацетилглюкозамин, а в B, D и F - как N-ацетилглюкозамин, так и N-ацетилмурамовая кислота. Молекула субстрата в активном центре принимает конформацию, близкую к конформации переходного состояния. В соответствии с механизмом Филлипса, лизоцим связывается с гексасахаридом, затем переводит 4-й остаток в цепи в конформацию твист-кресла. В этом напряженном состоянии гликозидная связь между центрами D и E легко разрушается. Ингибитором лизоцима служит, в частности, трисахарид N-ацетилглюкозамина, связывающийся с каталитически неактивными центрами A, B и C и препятствующий связыванию субстрата.

Остатки глутаминовой кислоты и аспарагиновой кислоты критичны для функционирования фермента, причем Asp52 ионизирован, а Glu35 нет. Некоторые авторы полагают, что Glu35 выступает в качестве донора протона при разрыве гликозидной связи субстрата, разрушая связь, а Asp52 выступает в роли нуклеофила, при образовании интермедиата — гликозил-фермента. Затем гликозил-фермент реагирует с молекулой воды, в результате чего фермент возвращается в исходное состояние и образуется продукт гидролиза.

Другие авторы полагают, что реакция протекает через образование карбоксоний-иона, стабилизированного заряженной карбоксильной группой Asp52, в то врямя как высвобождение спирта катализируется по механизму общего основного катализа незаряженным карбоксилом Glu35..

Просмотров: 3568

<<< Лактаза