Химия - Нуклеотидная последовательность
28 февраля 2011
Распечатка электрофореграммы, полученной с помощью автоматического секвенатора
Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.
Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.
- A = аденин
- C = цитозин
- G = гуанин
- T = тимин
- R = G A гуанин или аденин — пуриновые основания
- Y = T C пиримидиновые основания
- K = G T содержащие кето-группу
- M = A C содержащие аминогруппу
- S = G C «сильные», образующие 3 водородные связи
- W = A T «слабые», образующие 2 водородные связи
- B = G T C
- D = G A T
- H = A C T
- V = G C A
- N = A G C T
Cимволы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна, или известны разные ее варианты.
Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U.
Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.
Просмотров: 1730
|
|