Химия - Поиск количественных соотношений структура-свойство - Моделирование свойств при невекторном описании химических соединений

01 марта 2011


Оглавление:
1. Поиск количественных соотношений структура-свойство
2. Моделирование свойств при векторном описании химических соединений
3. Моделирование свойств при невекторном описании химических соединений

Моделирование свойств при невекторном описании химических соединений осуществляется либо при помощи нейронных сетей специальных архитектур, позволяющих работать непосредственно с матрицами смежности молекулярных графов, либо при помощи ядерных методов с использованием специальных графовых ядер.

Примерами служащих для этой цели нейронных сетей со специальной архитектурой являются:

1. BPZ
2. ChemNet
3. CCS
4. MolNet
5. Graph machines

Примерами служащих для этой цели графовых ядер являются:

1. Marginalized graph kernel
2. Optimal assignment kernel
3. Pharmacophore kernel

Примеры прогнозирования

Примеры прогнозирования физико-химических свойств органических соединений

1. Физические свойства индивидуальных низкомолекулярных соединений
   1. Температура кипения
   2. Критическая температура
   3. Вязкость
   4. Давление насыщенного пара
   5. Плотность
   6. Показатель преломления
   7. Температура плавления
   8. Шкалы полярности растворителей
   9. Индексы удержания в газовой хроматографии
   10. Поляризуемость
   11. Магнитная восприимчивость
   12. Энтальпия сублимации
2. Физические свойства низкомолекулярных соединений в зависимости от условий
   1. Температура кипения углеводородов в зависимости от давления
   2. Плотность углеводородов в зависимости от температуры
   3. Динамическая вязкость углеводородов в зависимости от температуры
3. Спектроскопические свойства
   1. Положение длинноволновой полосы поглощения симметричных цианиновых красителей
   2. Химические сдвиги в спектрах H ЯМР
   3. Химические сдвиги в спектрах С ЯМР
   4. Химические сдвиги в спектрах P ЯМР
4. Физическо-химические свойства низкомолекулярных соединений
   1. Температура вспышки и темпертура самовоспламенения
   2. Октановые числа углеводородов
   3. Константы ионизации
5. Физические свойства, обусловленные межмолекулярными взаимодействиями молекул разного типа
   1. Растворимость в воде
   2. Коэффициент распределения n-октанол/вода
   3. Коэффициент распределения низкомолекулярных веществ между водой и мицеллами Pluronic P85
   4. Свободная энергия сольватации органических молекул в различных растворителях
6. Реакционная способность органических соединений
   1. Константа скорости кислотного гидролиза сложных эфиров
7. Супрамолекулярные свойства
   1. Стабильность комплексов включения органических соединений с бета-циклодекстрином
   2. Сродство красителей к целлюлозному волокну
   3. Константы устойчивости комплексов ионофоров с ионами металлов
8. Физические свойства поверхностно-активных веществ
   1. Критическая концентрация мицеллообразования
   2. Температура помутнения
9. Физические и физико-химические свойства полимеров
   1. Температура стеклования
   2. Показатель преломления полимеров
   3. Ускорение вулканизации резин
   4. Коэффициент проницаемости через полиэтилен низкой плотности

Примеры прогнозирования свойств ADMET

1. Фармакокинетические свойства
   1. Проникновение через гематоэнцефалический барьер
   2. Скорость проникновения через кожу
2. Метаболизм
   1. Сайты ароматического гидроксилирования при метаболической активации цитохромом P450
3. Токсичность
   1. Канцерогенность
   2. Эмбриотоксичность

Примеры прогнозирования биологической активности органических соединений

1. Спектр биологической активности

Просмотров: 3731

<<< Молекулярный граф

Теорема Редфилда Пойа >>>