Химия - Рибонуклеазы - Классификация
28 февраля 2011Оглавление:
1. Рибонуклеазы
2. Классификация
Основные типы эндорибонуклеаз
- РНКаза A широко используется в биохимических лабораториях. Например, рибонуклеаза А из поджелудочной железы быка является одним из наиболее широко используемых в лабораторной практике ферментов. Специфична к одноцепочечным РНК, разрезает 3’-конец неспаренных цитидиловых и уридиловых нуклеотидов, оставляя 3'-фосфорилированный продукт в виде 2',3'-циклического монофосфата.
- РНКаза H расщепляет РНК, находящуюся в виде гетеродуплекса РНК/ДНК. При действии рибонуклеазы Н образуется одноцепочечная ДНК. Рибонуклеаза H является неспецифической эндонуклеазой и катализирует расщепление РНК по механизму гидролиза в присутствии связанного двухвалентного иона металла. В результате активности рибонуклеазы Н образуется 5'-фосфорилированный продукт.
- РНКаза I разрезает 3'-конец одноцепочечных РНК, по всем нуклеотид-нуклеотидным связям, оставляя на 5'-конце гидроксильную группу и фосфат на 3'-концу, через переходное состояние в виде 2',3'-циклического монофосфата.
- РНКаза III рибонуклеаза, вырезающая 16S и 23S рибосомные РНК из продукта транскрипции полицистронного оперона рибосомных РНК у прокариот. РНКаза III расщепляет двухцепочечные РНК, разрезает пре-микроРНК по специфическим сайтам, образуя более короткие микроРНК, и таким образом принимает участие в регуляции периода жизни мРНК.
- интерферон-индуцируемая нуклеаза, после индукции расщепляет все РНК в клетке.
- РНКаза P представляет собой рибозим молекулу РНК с каталитическими свойствами, принимает участие в метаболизме транспортных РНК.
- RNase PhyM специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец неспаренных адениловых и уридиловых нуклеотидов.
- RNase T1 специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец неспаренных гуаниловых нуклеотидов.
- RNase T2 специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец по всем азотистым основаниям, но преимущественно по адениловым.
- RNase U2 специфична к одноцепочечным РНК, разрезает по 3'-концу неспаренных адениловых оснований.
- RNase V1 сиквенс-неспецифична к двухцепочечным РНК, разрезает любые спаренные нуклеотиды.
- RNase V
Основные типы экзорибонуклеаз
- Полинуклеотидфосфорилаза имеет как экзонуклеазную, так и нуклеотидтрансферазную активность.
- РНКаза PH имеет как экзонуклеазную, так и нуклеотидтрансферазную активность.
- РНКаза II расщепляет одноцепочечную РНК в направлении 3'-5'.
- РНКаза R является близким гомологом РНКазы II, однако, в отличие от РНКазы II, расщепляет РНК со вторичными структурами без участия вспомогательных факторов.
- РНКаза D расщепляет пре-тРНК в направлении 3'-5'.
- РНКаза T основной фермент созревания стабильных РНК в направлении 3'-5'.
- Олигорибонуклеаза расщепляет короткие олигонуклеотиды до мононуклеотидов.
- Экзорибонуклеаза I расщепляет одноцепочечные РНК в направлении от 5' к 3'-концу, обнаружена только у эукариот.
- Экзорибонуклеаза II близкий гомолог экзорибонуклеазы I.
Просмотров: 2457
|