Химия - Фармакофор
28 февраля 2011Оглавление:
1. Фармакофор
2. Программное обеспечение для моделирования фармакофоров
Термин фармакофор был введен Паулем Эрлихом в 1909 г.:
Фармакофор — это молекулярный остов, который несет существенные признаки, ответственные за биологическую активность лекарства.
В 1977 г. это определение было модифицировано Питером Гундом:
Фармакофор — это набор структурных признаков в молекуле, которые распознаются биологическими рецепторами и являются ответственными за биологическую активность молекулы.
Определение ИЮПАК таково:
Фармакофор — это набор пространственных и электронных признаков, необходимых для обеспечения оптимальных супрамолекулярных взаимодействий со специфической биологической мишенью, которые могут вызывать ее биологический ответ.
Под фармакофорными признаками обычно понимаются фармакофорные центры и интервалы расстояний между ними, необходимые для проявления данного типа биологической активности. Типичными фармакофорными центрами при этом являются: гидрофобные области, ароматические кольца, доноры и акцепторы водородной связи, анионные и катионные центры. Для более детального описания фармакофора часто используют гидрофобные и исключенные объемы, а также допустимые интервалы угловой ориентации векторов водородных связей и плоскостей ароматических колец. При фармакофорном поиске проводится поиск соответствия между описанием фармакофора и характеристиками молекул из базы данных, находящихся в допустимых конформациях.
Просмотров: 3156
|
|