Химия - Рибонуклеазы - Классификация

28 февраля 2011


Оглавление:
1. Рибонуклеазы
2. Классификация

Основные типы эндорибонуклеаз

• РНКаза A — широко используется в биохимических лабораториях. Например, рибонуклеаза А из поджелудочной железы быка является одним из наиболее широко используемых в лабораторной практике ферментов. Специфична к одноцепочечным РНК, разрезает 3’-конец неспаренных цитидиловых и уридиловых нуклеотидов, оставляя 3'-фосфорилированный продукт в виде 2',3'-циклического монофосфата.
• РНКаза H — расщепляет РНК, находящуюся в виде гетеродуплекса РНК/ДНК. При действии рибонуклеазы Н образуется одноцепочечная ДНК. Рибонуклеаза H является неспецифической эндонуклеазой и катализирует расщепление РНК по механизму гидролиза в присутствии связанного двухвалентного иона металла. В результате активности рибонуклеазы Н образуется 5'-фосфорилированный продукт.
• РНКаза I разрезает 3'-конец одноцепочечных РНК, по всем нуклеотид-нуклеотидным связям, оставляя на 5'-конце гидроксильную группу и фосфат на 3'-концу, через переходное состояние в виде 2',3'-циклического монофосфата.
• РНКаза III — рибонуклеаза, вырезающая 16S и 23S рибосомные РНК из продукта транскрипции полицистронного оперона рибосомных РНК у прокариот. РНКаза III расщепляет двухцепочечные РНК, разрезает пре-микроРНК по специфическим сайтам, образуя более короткие микроРНК, и таким образом принимает участие в регуляции периода жизни мРНК.
• интерферон-индуцируемая нуклеаза, после индукции расщепляет все РНК в клетке.
• РНКаза P — представляет собой рибозим — молекулу РНК с каталитическими свойствами, принимает участие в метаболизме транспортных РНК.
• RNase PhyM специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец неспаренных адениловых и уридиловых нуклеотидов.
• RNase T1 — специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец неспаренных гуаниловых нуклеотидов.
• RNase T2 — специфична к одноцепочечной РНК, разрезает 3'-конец по всем азотистым основаниям, но преимущественно по адениловым.
• RNase U2 — специфична к одноцепочечным РНК, разрезает по 3'-концу неспаренных адениловых оснований.
• RNase V1 — сиквенс-неспецифична к двухцепочечным РНК, разрезает любые спаренные нуклеотиды.
• RNase V

Основные типы экзорибонуклеаз

• Полинуклеотидфосфорилаза имеет как экзонуклеазную, так и нуклеотидтрансферазную активность.

• РНКаза PH имеет как экзонуклеазную, так и нуклеотидтрансферазную активность.

• РНКаза II расщепляет одноцепочечную РНК в направлении 3'-5'.

• РНКаза R является близким гомологом РНКазы II, однако, в отличие от РНКазы II, расщепляет РНК со вторичными структурами без участия вспомогательных факторов.

• РНКаза D расщепляет пре-тРНК в направлении 3'-5'.

• РНКаза T — основной фермент созревания стабильных РНК в направлении 3'-5'.

• Олигорибонуклеаза расщепляет короткие олигонуклеотиды до мононуклеотидов.

• Экзорибонуклеаза I расщепляет одноцепочечные РНК в направлении от 5' к 3'-концу, обнаружена только у эукариот.

• Экзорибонуклеаза II — близкий гомолог экзорибонуклеазы I.

Просмотров: 2456

<<< Рибонуклеаза Т1

Шифр КФ >>>